Das Rotaugen-Buschkrokodil ist ein auffälliger, kleiner Echsenvertreter mit urtümlichem Erscheinungsbild. Es besitzt:
Eine dunkelbraune bis schwarze Grundfärbung
Deutlich ausgeprägte, panzerartige Schuppen, die an ein Mini-Krokodil erinnern
Knallrote Augen, die ihm seinen deutschen Trivialnamen verleihen
Eine aufgerichtete, gezackte Rückenlinie mit vier bis fünf dornigen Rückenschuppenpaaren
Einen kräftigen Schwanz, der bei Gefahr abgeworfen werden kann (Autotomie)
Männchen und Weibchen lassen sich schwer unterscheiden, jedoch haben Männchen häufig vergrößerte Poren in der Leistengegend.